Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.4 ms