Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn2bQ0KL01 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms