Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MestQ07646 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
MestQ07646 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MestQ07646 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MestQ07646 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
MestQ07646 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MestQ07646 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MestQ07646 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MestQ07646 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MestQ07646 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MestQ07646 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MestQ07646 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MestQ07646 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MestQ07646 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MestQ07646 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MestQ07646 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MestQ07646 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MestQ07646 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MestQ07646 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MestQ07646 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
MestQ07646 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MestQ07646 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MestQ07646 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MestQ07646 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MestQ07646 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MestQ07646 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MestQ07646 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MestQ07646 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MestQ07646 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
MestQ07646 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MestQ07646 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MestQ07646 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MestQ07646 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MestQ07646 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MestQ07646 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
MestQ07646 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MestQ07646 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
MestQ07646 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MestQ07646 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MestQ07646 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MestQ07646 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MestQ07646 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MestQ07646 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MestQ07646 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
MestQ07646 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MestQ07646 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
MestQ07646 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MestQ07646 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MestQ07646 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MestQ07646 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MestQ07646 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
MestQ07646 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MestQ07646 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MestQ07646 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MestQ07646 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MestQ07646 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MestQ07646 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MestQ07646 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MestQ07646 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
MestQ07646 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
MestQ07646 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
MestQ07646 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
MestQ07646 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
MestQ07646 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
MestQ07646 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
MestQ07646 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
MestQ07646 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
MestQ07646 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
MestQ07646 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
MestQ07646 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MestQ07646 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MestQ07646 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MestQ07646 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MestQ07646 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MestQ07646 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MestQ07646 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MestQ07646 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MestQ07646 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MestQ07646 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MestQ07646 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MestQ07646 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MestQ07646 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
MestQ07646 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
MestQ07646 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
MestQ07646 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MestQ07646 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
MestQ07646 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
MestQ07646 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MestQ07646 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MestQ07646 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MestQ07646 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MestQ07646 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms