Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms