Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gdf3Q07104 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gdf3Q07104 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gdf3Q07104 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Gdf3Q07104 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Gdf3Q07104 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Gdf3Q07104 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Gdf3Q07104 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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