Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Thbs3Q05895 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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Thbs3Q05895 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Thbs3Q05895 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Thbs3Q05895 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Thbs3Q05895 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Thbs3Q05895 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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