Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Kcnb1Q03717 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Kcnb1Q03717 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Kcnb1Q03717 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Kcnb1Q03717 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Kcnb1Q03717 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Kcnb1Q03717 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Kcnb1Q03717 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Kcnb1Q03717 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Kcnb1Q03717 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Kcnb1Q03717 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Kcnb1Q03717 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Kcnb1Q03717 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Kcnb1Q03717 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Kcnb1Q03717 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Kcnb1Q03717 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Kcnb1Q03717 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Kcnb1Q03717 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Kcnb1Q03717 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Kcnb1Q03717 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms