Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl7Q03366 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms