Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms