Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms