Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms