Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms