Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RhodP97348 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RhodP97348 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RhodP97348 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
RhodP97348 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RhodP97348 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RhodP97348 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RhodP97348 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RhodP97348 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
RhodP97348 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
RhodP97348 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
RhodP97348 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RhodP97348 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
RhodP97348 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RhodP97348 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
RhodP97348 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RhodP97348 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
RhodP97348 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
RhodP97348 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
RhodP97348 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RhodP97348 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RhodP97348 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
RhodP97348 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
RhodP97348 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RhodP97348 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RhodP97348 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RhodP97348 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RhodP97348 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RhodP97348 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RhodP97348 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RhodP97348 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RhodP97348 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
RhodP97348 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
RhodP97348 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
RhodP97348 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RhodP97348 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
RhodP97348 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RhodP97348 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RhodP97348 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RhodP97348 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RhodP97348 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RhodP97348 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RhodP97348 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
RhodP97348 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RhodP97348 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
RhodP97348 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RhodP97348 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RhodP97348 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RhodP97348 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RhodP97348 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RhodP97348 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RhodP97348 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
RhodP97348 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RhodP97348 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RhodP97348 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RhodP97348 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RhodP97348 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RhodP97348 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RhodP97348 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RhodP97348 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RhodP97348 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RhodP97348 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RhodP97348 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RhodP97348 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RhodP97348 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RhodP97348 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RhodP97348 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RhodP97348 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RhodP97348 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RhodP97348 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RhodP97348 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RhodP97348 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
RhodP97348 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RhodP97348 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
RhodP97348 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RhodP97348 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RhodP97348 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RhodP97348 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RhodP97348 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RhodP97348 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RhodP97348 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RhodP97348 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RhodP97348 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RhodP97348 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RhodP97348 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RhodP97348 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RhodP97348 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RhodP97348 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RhodP97348 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RhodP97348 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RhodP97348 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RhodP97348 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RhodP97348 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RhodP97348 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RhodP97348 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RhodP97348 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RhodP97348 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RhodP97348 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
RhodP97348 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RhodP97348 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms