Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx1P81068 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx1P81068 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx1P81068 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx1P81068 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx1P81068 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx1P81068 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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