Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp46P62069 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp46P62069 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp46P62069 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp46P62069 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp46P62069 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp46P62069 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp46P62069 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp46P62069 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms