Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psme3P61290 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Psme3P61290 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psme3P61290 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psme3P61290 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psme3P61290 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psme3P61290 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psme3P61290 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Psme3P61290 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Psme3P61290 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms