Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CgnP59242 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CgnP59242 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CgnP59242 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CgnP59242 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CgnP59242 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CgnP59242 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CgnP59242 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CgnP59242 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CgnP59242 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CgnP59242 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CgnP59242 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CgnP59242 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CgnP59242 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CgnP59242 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CgnP59242 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CgnP59242 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CgnP59242 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CgnP59242 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CgnP59242 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CgnP59242 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CgnP59242 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CgnP59242 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CgnP59242 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CgnP59242 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CgnP59242 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CgnP59242 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CgnP59242 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CgnP59242 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CgnP59242 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CgnP59242 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CgnP59242 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CgnP59242 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CgnP59242 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CgnP59242 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CgnP59242 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CgnP59242 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CgnP59242 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CgnP59242 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CgnP59242 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CgnP59242 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CgnP59242 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CgnP59242 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CgnP59242 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CgnP59242 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CgnP59242 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CgnP59242 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CgnP59242 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CgnP59242 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CgnP59242 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CgnP59242 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CgnP59242 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CgnP59242 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CgnP59242 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CgnP59242 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CgnP59242 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CgnP59242 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CgnP59242 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CgnP59242 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CgnP59242 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CgnP59242 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CgnP59242 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CgnP59242 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CgnP59242 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CgnP59242 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CgnP59242 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CgnP59242 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CgnP59242 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CgnP59242 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CgnP59242 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CgnP59242 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CgnP59242 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CgnP59242 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CgnP59242 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CgnP59242 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CgnP59242 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CgnP59242 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CgnP59242 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CgnP59242 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CgnP59242 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CgnP59242 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CgnP59242 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CgnP59242 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CgnP59242 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CgnP59242 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CgnP59242 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CgnP59242 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CgnP59242 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CgnP59242 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CgnP59242 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CgnP59242 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CgnP59242 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CgnP59242 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CgnP59242 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CgnP59242 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CgnP59242 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CgnP59242 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CgnP59242 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CgnP59242 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CgnP59242 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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