Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scarf2P59222 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms