Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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Rad23bP54728 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rad23bP54728 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rad23bP54728 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rad23bP54728 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rad23bP54728 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rad23bP54728 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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