Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PctpP53808 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PctpP53808 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
PctpP53808 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
PctpP53808 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PctpP53808 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PctpP53808 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PctpP53808 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PctpP53808 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PctpP53808 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PctpP53808 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PctpP53808 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PctpP53808 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PctpP53808 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PctpP53808 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PctpP53808 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PctpP53808 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PctpP53808 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PctpP53808 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PctpP53808 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PctpP53808 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PctpP53808 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PctpP53808 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PctpP53808 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PctpP53808 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PctpP53808 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PctpP53808 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PctpP53808 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PctpP53808 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PctpP53808 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PctpP53808 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PctpP53808 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PctpP53808 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PctpP53808 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PctpP53808 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PctpP53808 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PctpP53808 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PctpP53808 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PctpP53808 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PctpP53808 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PctpP53808 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PctpP53808 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PctpP53808 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PctpP53808 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PctpP53808 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PctpP53808 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PctpP53808 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PctpP53808 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PctpP53808 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PctpP53808 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PctpP53808 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PctpP53808 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PctpP53808 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PctpP53808 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PctpP53808 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PctpP53808 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PctpP53808 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PctpP53808 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PctpP53808 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PctpP53808 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PctpP53808 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PctpP53808 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PctpP53808 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PctpP53808 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PctpP53808 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PctpP53808 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PctpP53808 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PctpP53808 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PctpP53808 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PctpP53808 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PctpP53808 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PctpP53808 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PctpP53808 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PctpP53808 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PctpP53808 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PctpP53808 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PctpP53808 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PctpP53808 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PctpP53808 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PctpP53808 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PctpP53808 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PctpP53808 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PctpP53808 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PctpP53808 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PctpP53808 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PctpP53808 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PctpP53808 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PctpP53808 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PctpP53808 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PctpP53808 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PctpP53808 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PctpP53808 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PctpP53808 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PctpP53808 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PctpP53808 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PctpP53808 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PctpP53808 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PctpP53808 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PctpP53808 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PctpP53808 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms