Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ube2e3P52483 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms