Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec1P51908 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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