Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

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Length 930 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
XpcP51612 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XpcP51612 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XpcP51612 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XpcP51612 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XpcP51612 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XpcP51612 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XpcP51612 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XpcP51612 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XpcP51612 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XpcP51612 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XpcP51612 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
XpcP51612 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XpcP51612 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XpcP51612 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XpcP51612 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XpcP51612 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
XpcP51612 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
XpcP51612 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
XpcP51612 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XpcP51612 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
XpcP51612 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XpcP51612 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XpcP51612 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XpcP51612 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XpcP51612 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XpcP51612 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XpcP51612 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XpcP51612 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XpcP51612 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XpcP51612 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XpcP51612 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XpcP51612 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XpcP51612 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XpcP51612 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XpcP51612 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XpcP51612 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XpcP51612 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XpcP51612 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XpcP51612 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XpcP51612 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
XpcP51612 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XpcP51612 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XpcP51612 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XpcP51612 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
XpcP51612 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XpcP51612 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XpcP51612 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XpcP51612 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XpcP51612 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XpcP51612 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
XpcP51612 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
XpcP51612 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XpcP51612 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XpcP51612 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XpcP51612 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XpcP51612 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XpcP51612 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XpcP51612 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XpcP51612 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XpcP51612 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XpcP51612 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XpcP51612 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XpcP51612 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XpcP51612 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XpcP51612 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XpcP51612 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
XpcP51612 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XpcP51612 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XpcP51612 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XpcP51612 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XpcP51612 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XpcP51612 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XpcP51612 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XpcP51612 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XpcP51612 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XpcP51612 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XpcP51612 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
XpcP51612 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XpcP51612 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XpcP51612 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XpcP51612 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
XpcP51612 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XpcP51612 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XpcP51612 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XpcP51612 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
XpcP51612 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XpcP51612 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XpcP51612 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
XpcP51612 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
XpcP51612 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
XpcP51612 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XpcP51612 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XpcP51612 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XpcP51612 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XpcP51612 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XpcP51612 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XpcP51612 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XpcP51612 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XpcP51612 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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