Protein–RNA interactions for Protein: P50580

Pa2g4, Proliferation-associated protein 2G4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pa2g4P50580 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pa2g4P50580 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms