Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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Hoxc13P50207 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Hoxc13P50207 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Hoxc13P50207 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Hoxc13P50207 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Hoxc13P50207 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Hoxc13P50207 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Hoxc13P50207 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Hoxc13P50207 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Hoxc13P50207 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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Hoxc13P50207 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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