Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpreP49446 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpreP49446 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpreP49446 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpreP49446 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpreP49446 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpreP49446 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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PtpreP49446 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpreP49446 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpreP49446 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpreP49446 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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