Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cox8bP48772 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms