Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LmnaP48678 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LmnaP48678 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LmnaP48678 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LmnaP48678 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LmnaP48678 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LmnaP48678 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LmnaP48678 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LmnaP48678 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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