Protein–RNA interactions for Protein: P47968

Rpia, Ribose-5-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpiaP47968 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RpiaP47968 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RpiaP47968 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RpiaP47968 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RpiaP47968 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RpiaP47968 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RpiaP47968 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RpiaP47968 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RpiaP47968 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RpiaP47968 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RpiaP47968 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms