Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab20P35295 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab20P35295 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab20P35295 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab20P35295 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab20P35295 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab20P35295 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab20P35295 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab20P35295 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab20P35295 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab20P35295 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab20P35295 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab20P35295 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab20P35295 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab20P35295 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab20P35295 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab20P35295 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab20P35295 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab20P35295 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab20P35295 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab20P35295 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab20P35295 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab20P35295 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab20P35295 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab20P35295 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab20P35295 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab20P35295 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab20P35295 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab20P35295 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab20P35295 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab20P35295 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab20P35295 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab20P35295 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab20P35295 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab20P35295 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab20P35295 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab20P35295 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab20P35295 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab20P35295 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab20P35295 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab20P35295 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab20P35295 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab20P35295 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab20P35295 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab20P35295 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab20P35295 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab20P35295 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab20P35295 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab20P35295 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab20P35295 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab20P35295 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab20P35295 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab20P35295 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab20P35295 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab20P35295 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab20P35295 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab20P35295 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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