Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms