Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms