Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rom1P32958 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Rom1P32958 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Rom1P32958 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rom1P32958 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rom1P32958 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rom1P32958 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rom1P32958 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rom1P32958 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rom1P32958 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rom1P32958 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rom1P32958 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rom1P32958 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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