Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd28P31041 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd28P31041 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd28P31041 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd28P31041 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms