Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxraP28700 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxraP28700 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxraP28700 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxraP28700 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxraP28700 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxraP28700 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxraP28700 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxraP28700 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxraP28700 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxraP28700 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxraP28700 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxraP28700 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxraP28700 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxraP28700 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxraP28700 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxraP28700 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxraP28700 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxraP28700 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxraP28700 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxraP28700 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxraP28700 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxraP28700 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxraP28700 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxraP28700 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxraP28700 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxraP28700 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxraP28700 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxraP28700 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxraP28700 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxraP28700 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RxraP28700 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxraP28700 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxraP28700 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxraP28700 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxraP28700 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxraP28700 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxraP28700 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxraP28700 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RxraP28700 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxraP28700 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RxraP28700 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxraP28700 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxraP28700 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxraP28700 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxraP28700 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxraP28700 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxraP28700 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxraP28700 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxraP28700 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxraP28700 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxraP28700 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxraP28700 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxraP28700 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxraP28700 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxraP28700 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxraP28700 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxraP28700 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxraP28700 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxraP28700 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
RxraP28700 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxraP28700 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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RxraP28700 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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RxraP28700 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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RxraP28700 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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RxraP28700 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxraP28700 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxraP28700 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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RxraP28700 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxraP28700 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxraP28700 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxraP28700 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxraP28700 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxraP28700 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxraP28700 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxraP28700 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxraP28700 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxraP28700 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxraP28700 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxraP28700 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxraP28700 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxraP28700 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxraP28700 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxraP28700 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RxraP28700 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RxraP28700 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RxraP28700 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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