Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb9P28076 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms