Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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PdgfraP26618 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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PdgfraP26618 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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PdgfraP26618 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms