Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NdnP25233 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NdnP25233 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
NdnP25233 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
NdnP25233 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
NdnP25233 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
NdnP25233 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
NdnP25233 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
NdnP25233 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
NdnP25233 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
NdnP25233 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NdnP25233 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NdnP25233 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NdnP25233 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NdnP25233 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NdnP25233 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NdnP25233 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NdnP25233 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NdnP25233 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NdnP25233 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NdnP25233 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NdnP25233 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NdnP25233 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NdnP25233 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NdnP25233 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NdnP25233 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NdnP25233 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
NdnP25233 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NdnP25233 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NdnP25233 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NdnP25233 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NdnP25233 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
NdnP25233 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
NdnP25233 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
NdnP25233 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
NdnP25233 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NdnP25233 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NdnP25233 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NdnP25233 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NdnP25233 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NdnP25233 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
NdnP25233 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NdnP25233 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NdnP25233 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NdnP25233 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NdnP25233 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NdnP25233 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NdnP25233 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NdnP25233 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
NdnP25233 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NdnP25233 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NdnP25233 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NdnP25233 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NdnP25233 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NdnP25233 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
NdnP25233 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NdnP25233 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
NdnP25233 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
NdnP25233 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NdnP25233 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NdnP25233 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NdnP25233 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NdnP25233 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NdnP25233 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NdnP25233 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NdnP25233 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NdnP25233 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NdnP25233 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
NdnP25233 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NdnP25233 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NdnP25233 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
NdnP25233 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
NdnP25233 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NdnP25233 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
NdnP25233 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
NdnP25233 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
NdnP25233 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NdnP25233 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
NdnP25233 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
NdnP25233 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NdnP25233 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NdnP25233 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
NdnP25233 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
NdnP25233 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NdnP25233 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
NdnP25233 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NdnP25233 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NdnP25233 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms