Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkchP23298 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkchP23298 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkchP23298 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkchP23298 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkchP23298 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkchP23298 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkchP23298 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkchP23298 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkchP23298 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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