Protein–RNA interactions for Protein: P22646

Cd3e, T-cell surface glycoprotein CD3 epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eP22646 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd3eP22646 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd3eP22646 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms