Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18530 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18530 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18530 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18530 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18530 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18530 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18530 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18530 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18530 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18530 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18530 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18530 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18530 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P18530 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18530 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18530 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18530 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18530 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18530 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18530 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18530 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18530 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P18530 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18530 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18530 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18530 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18530 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P18530 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18530 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18530 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18530 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18530 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18530 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18530 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18530 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18530 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18530 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P18530 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18530 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18530 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18530 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18530 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18530 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18530 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18530 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18530 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18530 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18530 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18530 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18530 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18530 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18530 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P18530 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms