Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms