Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P10404 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P10404 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P10404 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P10404 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P10404 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P10404 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P10404 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P10404 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
P10404 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P10404 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P10404 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P10404 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P10404 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P10404 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P10404 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
P10404 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P10404 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
P10404 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
P10404 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P10404 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P10404 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P10404 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
P10404 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P10404 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
P10404 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
P10404 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
P10404 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
P10404 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P10404 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
P10404 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P10404 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P10404 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
P10404 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
P10404 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P10404 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
P10404 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
P10404 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
P10404 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
P10404 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
P10404 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P10404 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P10404 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P10404 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P10404 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
P10404 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P10404 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P10404 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P10404 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P10404 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P10404 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P10404 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P10404 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P10404 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P10404 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P10404 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P10404 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P10404 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P10404 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
P10404 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P10404 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P10404 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P10404 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P10404 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P10404 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P10404 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P10404 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P10404 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P10404 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P10404 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P10404 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P10404 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P10404 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P10404 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P10404 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
P10404 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P10404 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P10404 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P10404 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P10404 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
P10404 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P10404 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
P10404 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P10404 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P10404 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
P10404 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P10404 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P10404 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P10404 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P10404 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P10404 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P10404 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P10404 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P10404 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P10404 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P10404 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P10404 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P10404 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P10404 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P10404 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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