Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LtaP09225 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LtaP09225 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
LtaP09225 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LtaP09225 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LtaP09225 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LtaP09225 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LtaP09225 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
LtaP09225 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
LtaP09225 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
LtaP09225 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
LtaP09225 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
LtaP09225 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
LtaP09225 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
LtaP09225 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
LtaP09225 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LtaP09225 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
LtaP09225 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LtaP09225 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
LtaP09225 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LtaP09225 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
LtaP09225 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LtaP09225 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LtaP09225 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LtaP09225 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LtaP09225 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LtaP09225 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LtaP09225 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
LtaP09225 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LtaP09225 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
LtaP09225 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LtaP09225 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LtaP09225 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LtaP09225 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LtaP09225 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LtaP09225 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LtaP09225 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LtaP09225 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LtaP09225 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
LtaP09225 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LtaP09225 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LtaP09225 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LtaP09225 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
LtaP09225 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LtaP09225 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LtaP09225 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LtaP09225 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LtaP09225 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LtaP09225 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LtaP09225 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LtaP09225 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LtaP09225 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LtaP09225 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LtaP09225 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
LtaP09225 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
LtaP09225 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LtaP09225 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LtaP09225 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LtaP09225 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LtaP09225 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
LtaP09225 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
LtaP09225 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LtaP09225 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LtaP09225 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LtaP09225 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LtaP09225 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LtaP09225 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LtaP09225 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LtaP09225 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LtaP09225 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LtaP09225 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LtaP09225 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LtaP09225 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LtaP09225 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
LtaP09225 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LtaP09225 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
LtaP09225 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LtaP09225 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LtaP09225 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LtaP09225 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LtaP09225 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LtaP09225 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
LtaP09225 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LtaP09225 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms