Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Gm45701-201ENSMUST00000212049 235 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 AC132104.1-201ENSMUST00000213615 260 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 AC154595.1-201ENSMUST00000225533 1059 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 4930447F04Rik-201ENSMUST00000033525 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Hoxd3P09027 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
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Hoxd3P09027 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Hoxd3P09027 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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