Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spta1P08032 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Spta1P08032 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Spta1P08032 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Spta1P08032 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spta1P08032 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Spta1P08032 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spta1P08032 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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