Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P04212 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P04212 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P04212 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P04212 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P04212 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P04212 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P04212 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P04212 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P04212 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P04212 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P04212 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P04212 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P04212 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P04212 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P04212 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P04212 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P04212 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P04212 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P04212 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P04212 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P04212 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P04212 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P04212 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P04212 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P04212 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P04212 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P04212 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04212 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04212 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04212 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04212 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04212 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04212 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04212 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04212 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04212 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P04212 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04212 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04212 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04212 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04212 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04212 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04212 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04212 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04212 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P04212 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04212 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P04212 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P04212 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P04212 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P04212 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P04212 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04212 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04212 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04212 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04212 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04212 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04212 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04212 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04212 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04212 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04212 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04212 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04212 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P04212 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04212 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04212 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04212 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04212 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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P04212 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04212 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04212 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04212 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04212 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04212 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04212 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04212 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04212 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04212 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P04212 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P04212 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P04212 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P04212 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P04212 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P04212 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P04212 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P04212 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P04212 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P04212 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P04212 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P04212 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P04212 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P04212 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P04212 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P04212 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P04212 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P04212 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P04212 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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