Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01649 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01649 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01649 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01649 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01649 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01649 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01649 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01649 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01649 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01649 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01649 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01649 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01649 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01649 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01649 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01649 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01649 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01649 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01649 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01649 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01649 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01649 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01649 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01649 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01649 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01649 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01649 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01649 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01649 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01649 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01649 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01649 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P01649 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01649 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01649 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01649 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01649 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01649 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P01649 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01649 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01649 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01649 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01649 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01649 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms