Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Lnx1O70263 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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