Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffaO54786 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffaO54786 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffaO54786 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffaO54786 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffaO54786 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffaO54786 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffaO54786 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffaO54786 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffaO54786 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
DffaO54786 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
DffaO54786 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
DffaO54786 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
DffaO54786 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffaO54786 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffaO54786 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffaO54786 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffaO54786 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffaO54786 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffaO54786 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffaO54786 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffaO54786 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffaO54786 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffaO54786 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffaO54786 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffaO54786 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffaO54786 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffaO54786 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
DffaO54786 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffaO54786 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffaO54786 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffaO54786 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffaO54786 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffaO54786 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffaO54786 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffaO54786 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffaO54786 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffaO54786 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
DffaO54786 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffaO54786 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
DffaO54786 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffaO54786 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffaO54786 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
DffaO54786 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
DffaO54786 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
DffaO54786 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
DffaO54786 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffaO54786 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
DffaO54786 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffaO54786 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffaO54786 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffaO54786 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffaO54786 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffaO54786 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffaO54786 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffaO54786 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffaO54786 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffaO54786 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffaO54786 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffaO54786 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffaO54786 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffaO54786 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffaO54786 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffaO54786 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffaO54786 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffaO54786 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffaO54786 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffaO54786 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffaO54786 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffaO54786 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffaO54786 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffaO54786 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
DffaO54786 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffaO54786 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffaO54786 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffaO54786 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffaO54786 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffaO54786 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffaO54786 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffaO54786 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffaO54786 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffaO54786 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffaO54786 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffaO54786 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffaO54786 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffaO54786 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
DffaO54786 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffaO54786 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
DffaO54786 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffaO54786 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
DffaO54786 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffaO54786 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffaO54786 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffaO54786 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffaO54786 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffaO54786 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffaO54786 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffaO54786 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffaO54786 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffaO54786 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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